世界不思議

如果沒有病毒,可能就不會有今天的人類,病毒到底做了什麼?

2020年已經過去了2/3,全世界仍然沒有從年初爆發的新冠肺炎疫情中走出來。新型冠狀病毒給人類帶來了巨大的傷害,目前已經導致超過90萬人喪命。
對於病毒,我們一直都有著切膚之痛。不論是天花病毒還是埃博拉病毒,抑或是這些冠狀病毒,都給人類帶來了深重的災難。但是,凡事都有兩面性,病毒也有些值得稱道的方面。由於每一種病毒都只能特定攻擊某種生物或者細胞,所以在醫學上,有些專門克制某種細菌的病毒被人們使用,這就是所謂的噬菌體。在基因工程中,也有病毒被用來當做基因的載體,將特定的基因攜帶進目標細胞之中。

不僅如此,病毒還可以幫助我們瞭解生命的演化。而且,就在最近,東京大學病毒學家Masaharu Takemura和他的同事們發現,病毒不僅僅在今天成為了人類的工具,甚至在極其遙遠的生命早期,為生命的演化提供了一個極其重要的契機。甚至可以說,如果沒有那一次的陰差陽錯,今天都不會有人類出現。
2019年的時候,Takemura和他的同事們發現了一種非常巨大的病毒,並且將其命名為medusavirus。這個名字來源於希臘神話中的女妖美杜莎(Medusa),傳說任何敢看她眼睛的人,都會瞬間變成一塊石頭。因此,這種病毒也可以直譯為美杜莎病毒。
Takemura之所以將這個病毒命名為美杜莎,就在於它可以入侵到一種名為卡氏棘阿米巴(Acanthamoeba castellanii)的變形蟲體內,並且一旦成功入侵,它就可以迫使宿主的身體周圍結出堅硬的外殼,就好像變成了一塊石頭。

這個現象放在我們面前,的確就只有聯想到神話的份兒。但是對於科學家來說,他們想的就要更多、更遠了。
在對medusavirus進行研究的時候,Takemura又閱讀了其他大量的文獻。在此期間,他突發靈感,聯想到了當今生物的遠古祖先在進化過程中,出現細胞核的那個瞬間。他認為,細胞核的出現,或許就與這樣的病毒有關。
我們知道,雖然細胞是個非常微小的結構,但是麻雀雖小,五臟俱全。每一個細胞裡,還有著非常複雜的結構和各種各樣的組成部分。其中,細胞核就是非常重要的一部分,因為它儲存著真核生物生存的最基本物質——DNA。DNA是生命的基礎,它指導著生物會長成什麼樣、如何生存。因此,對於一個生物體來說,DNA至關重要。

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但是,在生物剛剛出現的年代,這些DNA都裸露在外,就在細胞內遊蕩。直到某一天,突然有一個細胞內出現了一個膜,將這些DNA包裹起來,形成了細胞核。至此,地球上的生物出現了一個全新的類型——真核生物。而那些沒有細胞核的生物則以自己方式繼續生存在今天的世界,那就是細菌這種原核生物。
不論是真核生物還是原核生物,都免不了會被病毒攻擊。在入侵細胞的病毒中,有一部分巨型病毒非常特別。這些病毒會利用細胞質膜將自己包裹起來,確保自己能夠安全地複製出更多的病毒。
而如今的研究顯示,病毒用來在細胞內包裹自己的膜,和真核細胞內的細胞核膜非常相似。那麼問題來了:這到底是一種巧合,還是二者之間有什麼關聯呢?

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正是在medusavirus的身上,Takemura等人找到了靈感。
和脊髓灰質炎病毒(小兒麻痺症)等病毒在宿主細胞內自己“建造家園”不同,medusavirus走了個捷徑,索性進入到宿主細胞的細胞核內,然後利用宿主細胞來實現自身的複製。在這個過程中,它並不會殺死宿主細胞,而是和宿主細胞的DNA一起完成複製。
而在medusavirus之中,研究人員發現了和它們的宿主相同的組蛋白和DNA聚合酶基因。這意味著,這些病毒可能和自己的宿主之間發生了一部分基因的轉移,供雙方使用。也就是說,medusavirus不是無償寄生,而是給宿主也提供了一些重要的基因,比如一些衣殼蛋白質。
Takemura在發表於《微生物學前沿》雜誌的論文中指出:“我認為,病毒複製DNA的工作有一部分也幫助了宿主進行基因的複製。從進化的角度來說,這是非常有利的。”

雖然它們的宿主阿米巴蟲是原核生物,但是研究人員相信,類似的過程很可能也會在病毒與真核生物之間上演。
以痘病毒為例,它也是一種巨型病毒,包含著非常多的遺傳物質,這些遺傳物質能夠編碼出多達400種以上的蛋白質。這些蛋白質中有一部分在真核細胞內也能發現,但是科學家從未在古細菌中發現。同時,科學家對痘病毒的DNA聚合酶進行分析後也發現,它與真核細胞的DNA聚合酶也有著密切的關聯。
同時,在這些DNA的內部,又出現了組蛋白的填充,螺旋結構的DNA纏繞在這些組蛋白周圍,變得更加緊湊。現在,研究人員也在一些現代的病毒內部發現了類似的DNA結構。

綜合上述這些發現,我們有理由相信,有些病毒在進入到宿主細胞內之後,會和宿主細胞發生遺傳物質的交換。也許在幾十億年前的某一天,有一個病毒寄生在某個細胞內,將自己攝取細胞質膜包裹自身的基因轉移到了宿主細胞的基因之中。於是,這個宿主細胞也開始利用這些膜來包裹自己的基因,開啟了真核生物的篇章。當然,這一切的推測還有待於更多證據的發現。
總之,如果沒有第一個真核細胞出現,也就不會有今天的地球。我們生活中能夠看見的一切生物,幾乎都是真核生物。假如第一個真核生物真的是被某個病毒感染後才學會了製造細胞核,那麼我們應該感謝這個病毒,是它憑藉一己之力,創造了今天物種繁盛的地球。

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